إعـــــــلان

تقليص
لا يوجد إعلان حتى الآن.

لدي مشكلة مع الـpcr وأريد نصيحة مجرب

تقليص
X
 
  • تصفية - فلترة
  • الوقت
  • عرض
إلغاء تحديد الكل
مشاركات جديدة

  • لدي مشكلة مع الـpcr وأريد نصيحة مجرب

    السلام عليكم

    وددت مشاركتكم لي في حل هذه المشكلة التي أتعبتني ولم أعرف لها سبب وهي

    قمت بتضخيم منطقة معينة من شريط dna بواسطة pcr وأعطتني النتيجة التي أريد ولكن عندما أعدت التفاعل مرة أخرى لم تظهر لي نتيجة وأعدتها كثير ولكن ((تحلف ما تبغى تعطي نتيجة مثل المرة الأولى))

    وإشتريت primer جديد نفس الذي استخدمته المرة الأولى و عملت له gradiant لنفس العينة ولكن أعطاني باند خفيفة جدا في نفس المكان مع ظهور باند أخرى ,,,

    وهناك عدة أسئلة تحيرني جدا:

    ما سبب ظهور الباند الثانية مع الصبغة كما في الصورة؟علما بأني أستخدم فلتر tips يعني متأكد مافي تلوث عندي

    الصورة الأولى هي gradiant المرة الأولى
    الصورة الثاني هي gradiant المرة الثانية

    برنامج التفاعل كا لتالي:
    Gradient Program

    BLOCK CNTRL
    LID=105°
    AUTO NOWAIT
    0:05:00 T= 96.0° 1
    0:00:35 T= 96.0° 2
    0:00:35 T= 63.0° 3
    +0:00 + 0.0
    +0:0°/s R= 3.0°/s
    G= 5.0°
    00:00:45 T= 72.0° 4
    REP 40 GOTO 2 5
    00:04:00 T= 72.0 ° 6
    ENTER Hold 4.0° 7
    end

    OPTIONS Show Gradient

    Settings: Tube: 0.2 ml T=60.0C G= 7.0C
    Pos. 1: 58C Pos. 5: 60.8C Pos. 9: 66.1C
    Pos. 2: 58.2C Pos. 6: 62.1C Pos:10: 67.2C
    Pos. 3: 58.7C Pos. 7: 63.5C Pos.11: 68C
    Pos. 4: 59.6C Pos. 8: 64.9C Pos.12: 68.5C
    الملفات المرفقة

  • #2
    من تجارب سابقة ، حاول تغيير annealing temperature
    على أفتراض أن جميع المكونات الاخرى well optomized واهمها الماغنيسيوم
    ألاحظ عدم وجود كونترول سلبي لأستبعاد أحتمال الcontamination

    تعليق


    • #3
      AS HE SAID annealing temperature must be at 62 degree centigrade after this step,should be completely dried

      تعليق


      • #4
        ارفع درجة الأنيلنج

        لأنه طالع في الصورة primer dimer

        تعليق


        • #5
          يعني أرفع درجة الأنيليج أكثر من 68؟؟؟؟؟؟

          أنا لاحظت من خلال الgradiant إن أول خانة في الجهاز درجة حرارتها 58 أعطت أفضل باند من آخر خانة ودرجة حرارتها 68

          حيرتوني أرفع ولا أخفض؟؟؟؟

          تعليق


          • #6
            أخي العزيز
            أبداء بدرجة أقل تتوقع تعطي باند sharp band
            ثم ارفع درجة الحرارة بواقع نصف درجة إلى أن تحصل على optimum temperature
            أو حاول الأتصال باي أحد يعمل على نفس قطعة DNA وأطلب منه الكونديشن بشكل كامل

            تعليق


            • #7
              إستخدمت نفس الكوندشن الموجود في الpaper نفسة ولكن دون جدوى

              تعليق


              • #8
                مرحبا
                دائما مايكون هناك شيء غامض في البيبر أو يضعون خطوة مفقودة
                لكن بودي اعرف هل مكونات البي سي آر تكون جاهزه و أو تحضرها أنت ؟أ
                هل جربت درجات مختلفة من الأنيلاينق ؟

                تعليق


                • #9
                  شوف يا طيب انا عندي لك حل

                  في طريقة اسمها Touchdown PCR تبدأ من تحت درجة ذوبان البرامير بنص و تنزل في كل سايكل نص الين ما توصل الي درجة الانيلنج المطلوبة .

                  نقول ان درجة ذوبان البرايمر 68

                  ابدا بـ 67.5
                  67
                  56.5
                  56
                  55.5
                  55
                  54.5
                  54
                  54.5
                  54

                  و هنا تكون أحسن درجة

                  تعليق


                  • #10
                    عندما تبداء العمل على أي جين - وخاصة إذا كان حديث الاكتشاف -، فأن الباحث قد يتوقع أن يجرب عدة ظروف إلى ان يحصل على الظروف المناسبة واللتي تعطي تكثير للجين بشكل تخصصي وهذا مايسمى ب optomization
                    الجدول التالي يوضح العوامل اللي يمكن تغييرها
                    [IMG][/IMG]


                    بالأضافة إلى تجربة عدة درجات من الانيالينق

                    تعليق

                    يعمل...
                    X